هدف البحث الحالي إلى التحقق من فاعلية الاستقصاء القائم على الجدل في تدريس العلوم المتكاملة في تنمية مهارات الفهم العميق والمرونة المعرفية لدى طلاب الصف الأول الثانوي، ولتحقيق هدف البحث تم استخدام التصميم شبه التجريبي ذي المجموعتين التجريبية والضابطة، وتكونت مجموعة البحث من (66) طالباً وطالبة بالصف الأول الثانوي بمدرسة المنشأة الكبرى الثانوية المشتركة التابعة لإدارة كفر شكر التعليمية، وتم تقسيمهم إلى مجموعتين إحداهما تجريبية قوامها (34) طالباً وطالبة درست باستخدام الاستقصاء القائم على الجدل، والأخرى ضابطة قوامها (32) طالباً وطالبة درست باستخدام الطريقة التقليدية، وتم إعداد أدوات البحث (اختبار الفهم العميق ومقياس المرونة المعرفية)، وتطبيقها قبلياً وبعدياً على مجموعتي البحث، وقد أظهرت النتائج وجود فروق ذات دلالة إحصائية بين متوسطي درجات المجموعتين التجريبية والضابطة في كل من اختبار الفهم العميق ومقياس المرونة المعرفية لصالح المجموعة التجريبية